Im Jahr 2000 startet beim FC Sachsen ein erneuter Versuch, Mädchen- und Frauenfußball in Leutzsch zu ermöglichen. Susanne Herzfeld legt dem Vorstand ein Konzept vor. 2002 entstehen Angebote für B- und C-Juniorinnen, die sehr gut angenommen werden. Martin Scholz leitet die Abteilung Mädchen- und Frauenfußball beim Verein. Ein Frauenteam auf dem Kleinfeld folgt 2003.

Mit dem Trainer Jürgen Ulm sowie den Betreuern Björn Burgold und Torsten Waldheim gewinnt das Frauenteam 2005 den Meistertitel.

Das Team steigt in die Bezirksliga Großfeld auf, kann aber an die Erfolge nicht anknüpfen. Auch ein zweites Frauenteam, das Kleinfeld spielt, und eine Bambini-Gruppe werden gegründet.

2007 erringen die B-Juniorinnen den Landesmeisterschaftstitel und wechseln auf Wunsch des Sächsischen Fußball-Verbandes komplett in das neue Sächsische Nachwuchsleistungszentrum des gerade gegründeten Leipziger FC 07 – darunter sind Spielerinnen wie Lisa Reichenbach oder Marie-Luise Herrmann. Damit endet das Kapitel Mädchen- und Frauenfußball beim FC Sachsen.